Les aires protégées sont caractérisées comme des espaces géographiques destinées à la conservation de la biodiversité floristique et faunique. Elles sont gérées par l’Etat et regroupe les parcs nationaux, les réserves de forestières et fauniques, ainsi que les sanctuaires de faune et de flore. La principale différence entre parcs nationaux et réserves forestières et fauniques réside en ce que les parcs sont aménager pour faciliter les visites des touristes tandis que les réserves sont uniquement accessible au spécialistes qui y travaillent. Les données de cette couche sont produites par le MINFOF et WRI avec le soutien de l'Agence Américaine pour le Développement International (USAID), du Ministère de l'Environnement de Norvège et le Département pour le Développement International de le Grande-Bretagne (DFID). Les contributions en logiciels proviennent du support d'ESRI et d'Erdas. Cette couche est continuellement mise à jour, suivant la disponibilité des nouveaux documents officiels ; à savoir les avis au public et les décrets de création dont les descriptifs sont faits à base des cartes topographiques (fond INC) à l'échelle de 1:200 000.